Prestations

Expertise en gestion, analyse et traitement d'image :

- Gestion du stockage et du partage de vos images,

- Conseil et accompagnement dans l'analyses de vos images (par exemple : améliorer la visualisation et le rendu puis assurer la mise en formes de figures d'article, utilisation des fonctions intégrées de quantification dans Image J...),

- Conception d'analyses spécifiques à une question biologique précise.

- Écriture de macros logiciel open source pour automatiser vos analyse et accompagnement dans leur compréhension pour leurs réutilisations,

- Écriture de programmes d'analyse complexe.

Contacts

Service de traitement et analyse d'images

IRS UN , 4e étage, pièce 416

SFR santé François Bonamy -IRS UN
8, quai Moncousu
BP 70721
44007 Nantes Cedex
 

Traitement d'Images

Gestion et stockage de données images

 

Nous pouvons vous aider à construire le plan de gestion des données de votre projet (DMP data management Plan).

La plateforme vous propose un accès web à vos données,hébergée sur notre serveur MicroPICell. Pour y accéder, envoyer un mail au service de traitement d'image qui vous proposera une formation de prise en main et vous créera un projet à accès sécurisé.

https://openimadis-micropicell.sante.univ-nantes.fr/

Accès depuis votre mobile ou tablette:

https://openimadis-micropicell.sante.univ-nantes.fr/iManage/m/login.html

Les fonctionnalités

  • Gestion des images quelque soit leur format : Parcourir et naviguer dans vos projet en utilisant une arborescence flexible basée sur vos annotations et les metadonnées des images.
  • Visualisation des images: Changer le contraste, les LUT, faire des projections en maximum d'intensité pour vos stacks, ou créer vos films mp4 en ligne sans modifier vos images d'origine.
  • Collaboration: Choisissez les collaborateurs et leur type d'accès à vos données (lecture seulement, droit d'écriture,..). Rajoutez l'utilisateur public pour un accès ouvert à vos données ou créer un compte "reviewer" pour partager vos données lors de vos soumissions.  Rajoutez du texte, des commentaires ou des annotations visuelles sur vos images pour les partager avec vos collaborateurs. Créez des liens de téléchargement direct sans connection, en format original ou en tif.
  • Traiter vos images sur la base de données: accéder depuis Icy, ImageJ/Fiji ou encore Matlab à vos données et sauver directement les résultats de vos analyses dans la base de données, ou encore en demandant l'installation d'un traitement spécifique sur notre serveur.

Tarification

 

Applicable au 1er Janvier 2019.

Après un premier rendez vous ou échange par mail, un devis vous sera fourni avec les tarifs suivants. Après validation du devis et réalisation de la prestation, la facturation apparaîtra dans votre prochain relevé de prestation MicroPICell.

L'unité de base de prestation (ajustable au prorata) est la journée d'analyse (7h).

Tarif Interne (laboratoires ou plateformes affiliés à la SFR http://www.sfrsante.univ-nantes.fr/unites-de-recherche/ ): 50 euros HT

Tarif académique autres: 80 euros HT

Tarif entreprise: 541 euros HT