Un microtome est un appareil utilisé pour la coupe fine de tissus fixés et inclus en paraffine. Cet appareil permet de faire des coupes de 2 à 25 µm d'épaisseur. Il est équipé d'un rasoir fixe et d'un porte objet supportant le bloc à couper, opérant un mouvement vertical alternatif.



La coupe du bloc permet d'obtenir des rubans de paraffine qui seront déposés sur une lame de verre. Après déparaffinage, coloration, immunohistochimie ou immunofluorescence, les coupes seront observées au microscope.